2005年6月，國務(wù)院批準中國證監會(huì )、財政部、中國人民銀行發(fā)布《證券投資者保護基金管理辦法》（以下簡(jiǎn)稱(chēng)《管理辦法》），同意設立國有獨資的中國證券投資者保護基金有限責任公司（以下簡(jiǎn)稱(chēng)“投保基金公司”），并批準了公司章程。2005年8月30日，投保基金公司在國家工商總局注冊成立，由國務(wù)院出資，財政部一次性撥付注冊資金63億元。投保基金公司歸口中國證監會(huì )管理。

　　公司設董事會(huì )，為公司的決策機構；設經(jīng)理層，主持公司的經(jīng)營(yíng)管理工作。公司內設12個(gè)部門(mén)，分別為黨委辦公室、紀檢辦公室、綜合部、資金監控與監管協(xié)作部、法律事務(wù)部、資產(chǎn)管理部、調查評價(jià)與研究部、投資者教育服務(wù)部、統計分析部、證券公司風(fēng)險監測部、財務(wù)部、信息技術(shù)部。董事會(huì )下設3個(gè)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )，分別為戰略發(fā)展委員會(huì )、投資決策委員會(huì )、薪酬管理委員會(huì )。公司下設1個(gè)控股子公司，北京中證保信息科技股份有限公司。

　　截至2019年底，公司共有干部97人，全部為本科及以上學(xué)歷，其中碩士及以上學(xué)歷人員占比76.30%。從專(zhuān)業(yè)上看，與公司業(yè)務(wù)相關(guān)的金融、法律、會(huì )計、統計、計算機相關(guān)專(zhuān)業(yè)人員占比約70%；從年齡上看，公司人員平均年齡為33歲，35歲以下員工占比62.90%。